什么是Cytoscape?
Cytoscape 是一个强大的图形可视化库，常用于生物信息学和社交网络分析等领域。它提供了许多灵活的功能，可以创建各种类型的图形。在 Cytoscape 中，你可以添加节点、边缘、标签和样式，并进行各种操作，例如布局、导出和动画等。
Cytoscape-Klay是什么？
Cytoscape-Klay 是一个基于 Cytoscape 的布局扩展，它使用 KlayJS 布局算法实现自动布局。它支持各种不同的布局类型，并提供许多参数来控制布局的细节。Cytoscape-Klay 是 Cytoscape 社区中最受欢迎的布局扩展之一。
安装Cytoscape-Klay
在开始使用 Cytoscape-Klay 前，你需要先安装 Cytoscape 和 Cytoscape-Klay。要安装 Cytoscape，可以使用以下命令：
npm install cytoscape --save
要安装 Cytoscape-Klay，可以使用以下命令：
npm install cytoscape-klay --save
使用Cytoscape-Klay
要使用 Cytoscape-Klay 布局扩展，首先需要将它添加到你的 Cytoscape 实例中。你可以使用以下代码：
import cytoscape from 'cytoscape'; import klay from 'cytoscape-klay'; cytoscape.use(klay);
现在，你已经成功将 Cytoscape-Klay 添加到了 Cytoscape 实例中。
接下来，你可以使用以下代码创建一个简单的图形，并设置 Cytoscape-Klay 作为默认布局算法：
-- -------------------- ---- ------- ----- -- - ----------- ---------- ------------------------------ --------- - - ----- - --- --- - -- - ----- - --- --- - -- - ----- - --- ----- ------- ---- ------- --- - - -- ------- - ----- ------ - ---展开代码
以上代码将创建包含两个节点和一条边的简单图形，并将 Cytoscape-Klay 设置为默认布局算法。要显示此图形，请在 HTML 文件中添加以下代码：
<div id="cy"></div>
现在，你应该可以看到一个包含两个节点和一条边的简单图形，并使用了 Cytoscape-Klay 自动布局。
Cytoscape-Klay的参数
Cytoscape-Klay 提供了许多参数来控制自动布局的细节。以下是一些常用的参数：
name: 布局名称，必须为klay。animate: 是否使用动画效果，默认为false。fit: 是否自适应画布大小，默认为true。padding: 画布内边距，默认为30。spacingFactor: 节点间距因子，默认为1.75。nodeDimensionsIncludeLabels: 节点大小是否包括标签，默认为false。klay: KlayJS 布局算法的参数，详见 KlayJS 文档。
以下是一个包含自定义参数的示例：
-- -------------------- ---- ------- ----- -- - ----------- ---------- ------------------------------ --------- - - ----- - --- --- - -- - ----- - --- --- - -- - ----- - --- ----- ------- ---- ------- --- - - -- ------- - ----- -- - ----------------------------------------------------------- -------- ----------------------------------------------------------------------------------展开代码
