简介
hubot-mopac 是一个基于 Hubot 的 npm 包，可以用于解析和计算小分子分子轨道能量、波函数和振动的程序 MOPAC 的输出文件。该输出文件一般以 .out 结尾。
安装
可以通过 npm 命令来安装：
npm install hubot-mopac
使用方法
初始化
在 Hubot 中使用该包前，需要先引入 hubot-mopac，并初始化：
const Hubot = require('hubot');
const Mopac = require('hubot-mopac');
const robot = new Hubot.Robot(...);
// 初始化 Mopac
robot.load(Mopac);解析输出文件
解析一个 MOPAC 的输出文件：
const path = require('path');
const fs = require('fs');
const outputFilepath = path.join(__dirname, './output/example.out');
const outputFileContent = fs.readFileSync(outputFilepath, { encoding: 'utf8' });
const mopacOutput = robot.brain.Mopac.parseOutputFile(outputFileContent);其中，output/example.out 是一个输出文件的路径，outputFileContent 是输出文件的内容，mopacOutput 是经 hubot-mopac 解析的输出文件的对象。
计算能量
计算和输出分子中所有原子和键的能量：
mopacOutput.calculateEnergy();
计算波函数
计算分子中每个原子轨道的精细度、轨道能量、轨道类型和 轨道系数：
mopacOutput.calculateWaveFunctions();
计算振动频率
计算分子的振动频率：
mopacOutput.calculateFrequency();
示例代码
以下是一个完整的示例代码，用于解析一个输出文件，计算能量、波函数和振动频率：
-- -------------------- ---- ------- ----- ----- - ----------------- ----- ----- - ----------------------- ----- ---- - ---------------- ----- -- - -------------- ----- ----- - --- ----------------- -- --- ----- ------------------ -- ------ ----- -------------- - -------------------- ------------------------ ----- ----------------- - ------------------------------- - --------- ------ --- ----- ----------- - ----------------------------------------------------- -- ---- ------------------------------ ------------------ -------------------- -- ----- ------------------------------------- ------------------- --------------------------- -- ------ --------------------------------- -------------------- -----------------------
详细文档
更详细的文档，请参考官方文档：https://github.com/hubot-scripts/hubot-mopac。
结语
hubot-mopac 为计算小分子分子轨道能量、波函数和振动提供了复杂计算的便捷方法，对于化学科普和学习有着重要的指导意义。
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