前言
对于生物医学领域的研究人员来说，NCBI 数据库（National Center for Biotechnology Information）是必不可少的资源之一。NCBI 数据库中集成了各种生物医学文献和序列，通过计算机程序来检索和利用这些数据可以加快研究进度。本教程将介绍一个基于 npm 包 machinepack-ncbi 的工具，帮助前端开发者在 NCBI 数据库中自动化搜索和获取数据。
简介
machinepack-ncbi 是一个针对 NCBI 数据库的 Node.js 模块。它提供了一组简单易用的 API 接口，帮助开发者在 NCBI 中进行搜索，获取文献、序列等数据。
machinepack-ncbi 提供了以下功能：
search: 在 NCBI 数据库中搜索文献或序列。fetch: 获取指定 ID 的文献或序列信息。blast: 在 NCBI 数据库中进行序列比对。summary: 获取文献或序列的摘要信息。related: 获取与指定文献或序列相关的其他文献或序列信息。
安装
首先，需要安装最新版的 Node.js 和 npm 包管理器。然后，在命令行中执行以下命令安装 machinepack-ncbi：
npm install machinepack-ncbi
使用
在使用前，请先申请 NCBI 开发者账号并获取 API Key，否则访问 API 将会受到限制。
搜索
使用 search 方法进行文献或序列的搜索。以下是一个例子：
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---db: 指定搜索的数据库，例如pubmed、nucleotide、protein等。term: 指定搜索的关键词。retmax: 指定返回的最大数量。
获取
使用 fetch 方法获取指定 ID 的文献或序列。以下是一个例子：
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---id: 指定查询的 ID。
比对
使用 blast 方法在 NCBI 数据库中进行序列比对。以下是一个例子：
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---program: 指定比对的程序，例如blastp、blastn、blastx等。database: 指定比对的数据库，例如nr、nt、pdb等。sequence: 指定比对的序列。
摘要
使用 summary 方法获取文献或序列的摘要信息。以下是一个例子：
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---id: 指定查询的 ID。
关联
使用 related 方法获取与指定文献或序列相关的其他文献或序列信息。以下是一个例子：
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---id: 指定查询的 ID。
结语
通过 machinepack-ncbi，前端开发人员可以方便、快速地在 NCBI 数据库中获取生物医学数据。本教程提供了一系列基本用例，希望能够对大家有所帮助。
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