npm 包 mi-sbgn 使用教程

简介

mi-sbgn 是一个 Node.js 模块,其作用是解析和生成 Systems Biology Graphical Notation (SBGN) 图形与结构数据。SBGN 是一种描述生物系统的图形化标识语言,模型可以包含由化合物、基因、基因产物等构成的复杂网络。

安装

使用 npm 进行全局安装或将其作为开发依赖:

--- ------- -- -------

--- ------- ---------- -------

解析 SBGN

以下是一个解析 SBGN 图的 JavaScript 代码示例。

----- ------ - -------------------

--- ------- - ------ ------  -- ---- --- --

--- ------- - -
  -- ----
--

--- -------- - --------------------- ---------
----------------------

在以上代码中,变量 sbgnXML 存储了 SBGN XML 数据,变量 options 为解析选项。miSbgn.parse() 方法会将 SBGN XML 数据解析为 JSON 格式的数据,并将其存储在 sbgnJson 变量中。console.log() 方法用于在控制台输出 sbgnJson

生成 SBGN

以下是一个生成 SBGN 图的 JavaScript 代码示例。

----- ------ - -------------------

--- -------- - -
  -- ---- ---- --
--

--- ------- - -
  -- ----
--

--- ------- - ------------------------- ---------
---------------------

在以上代码中,变量 sbgnJson 存储了 SBGN JSON 数据,变量 options 为生成选项。miSbgn.generate() 方法会将 SBGN JSON 数据生成为 SBGN XML 数据,并将其存储在 sbgnXML 变量中。console.log() 方法用于在控制台输出 sbgnXML

示例

以下是一个使用 mi-sbgn 解析和生成 SBGN 图的完整示例。

----- ------ - -------------------

-- ---- --- --
--- ------- - -
  ----- ----
    ---
  -------
--

-- ----
--- ------------ - -
  --------- -----  -- ----
  ---------- ----  -- ------
--

-- ----
--- --------------- - -
  ------- ----------  -- ----
  ------- -  -  -- ------
--

-- -- ----
--- -------- - --------------------- --------------

-- -- ---- ---- --
------------------------------- - ---- -------
----------------------------- - -
  ------ --
  --------- -----
--

-- -- ----
--- ---------- - ------------------------- -----------------

------------------------

在以上示例中,变量 sbgnXML 存储了 SBGN XML 数据,变量 parseOptionsgenerateOptions 分别为解析和生成的选项。使用 miSbgn.parse() 方法将 SBGN XML 数据解析为 JSON 格式的数据,并修改 JSON 数据。最后使用 miSbgn.generate() 方法将新的 JSON 数据生成为 SBGN XML 数据,并将其存储在 newSbgnXML 变量中。console.log() 方法用于在控制台输出 newSbgnXML

结论

mi-sbgn 是一个方便易用的 SBGN 解析和生成工具,能够帮助前端开发者减少 SBGN 数据处理方面的工作量。学会使用 mi-sbgn 不仅能提高开发效率,同时也能更好地理解和应用 SBGN 技术。

来源:JavaScript中文网 ,转载请联系管理员! 本文地址:https://www.javascriptcn.com/post/600568ba81e8991b448e486d


猜你喜欢

  • npm 包 activebulma 使用教程

    在前端开发中,UI 框架扮演着非常重要的角色。Bulma 是一个 CSS 框架,它不仅提供了许多常见界面元素的样式,还非常轻量级且易于定制。在本教程中,我们将介绍一个 npm 包——activebul...

    3 年前
  • npm 包 karma-japa 使用教程

    karma-japa 是一个基于 Karma 的测试框架,使用 Japa 作为测试运行器的前端测试框架,提供了一个方便简洁的测试方式。本文将详细介绍 karma-japa 的安装使用方法,并附带示例代...

    3 年前
  • npm 包 stylus-utility 使用教程

    在前端开发中,为了提高开发效率,我们需要使用一些工具来简化我们的操作和提升代码质量。stylus-utility 是一个优秀的 npm 包,可以帮助我们在使用 stylus 时更加高效地编写 CSS ...

    3 年前
  • npm 包 aws-lambda-chrome 使用教程

    简介 在 serverless 架构中,运行无头浏览器(Headless Browser) 是非常常见的需求。aws-lambda-chrome 就是一个能够在 AWS Lambda 上运行无头浏览器...

    3 年前
  • npm包react-tunnel-16使用教程

    在前端开发中,React是一个非常流行的框架。如果你刚刚开始使用React,你可能会遇到一些难题。比如需要在组件之间共享数据或调用函数,如果使用props或redux的话,代码会变得冗长或繁琐。

    3 年前
  • npm 包 isit-code-delduca 使用教程

    简介 npm 包 isit-code-delduca 是一个用于检查 JavaScript 代码是否符合 Del Duca 指南的工具。Del Duca 是一个流行的 JavaScript 风格指南,...

    3 年前
  • npm 包 icebreaker.io-client 使用教程

    前言 在前端开发中,有时候我们需要实现实时通信的功能,而常用的方式是使用 WebSocket。icebreaker.io-client 是一个基于 WebSocket 的实时通信库,具有良好的兼容性和...

    3 年前
  • isit-site-tools-delduca 使用教程

    isit-site-tools-delduca 是一个前端开发工具集,它提供了各种实用工具,比如格式化日期、生成随机字符串等等。在本文中,我们将会详细介绍如何使用这个工具集。

    3 年前
  • npm 包 node-red-contrib-opentimestamps 使用教程

    在使用区块链技术存储数据的过程中,我们经常需要对数据进行时间戳签名,以证明数据是在特定的时间点创建或修改的。而 opentimestamps 是一种开源的时间戳服务协议,可以帮助我们实现时间戳签名的功...

    3 年前
  • npm 包 openprofiler 使用教程

    简介 openprofiler 是一个开源的性能分析工具,通过加载一段 JS 脚本来收集网页的性能数据并上传到相应的服务器上进行分析。该工具可以用于前端开发人员进行性能优化时使用。

    3 年前
  • npm包flexiblegrid使用教程

    随着移动设备的普及,响应式设计与弹性网格布局成为了前端开发中不可忽视的优化问题。flexiblegrid是一款基于Sass开发的弹性网格布局框架,可以快速构建自适应的页面布局。

    3 年前
  • npm 包 litera 使用教程

    前言 在现代 web 技术中,前端框架和库层出不穷,这些库和框架的出现大大提高了前端的开发效率和维护性。其中,npm 是前端领域最常用的包管理工具之一,可以帮助前端开发者管理自己的代码和使用第三方库。

    3 年前
  • npm 包 bcash-instadump 使用教程

    简介 在前端开发中,我们经常会遇到需要处理数字货币的情况。bcash-instadump 是一个 npm 包,它提供了一种快速解析比特币交易所 API 接口数据的方法。

    3 年前
  • npm 包 de.type.css 使用教程

    在前端开发中,CSS 是非常重要的技术之一。而在 CSS 编写过程中,开发者可能会面临一些繁琐的工作,如频繁修改颜色、间距等属性。为了解决这些问题,出现了一些优秀的 CSS 库。

    3 年前
  • npm 包 find.js 使用教程

    前言 在前端开发中,难免需要从一个对象或数组中找到符合条件的元素或值。虽然 JavaScript 自带一些查找函数,但对于一些特殊的查找需求,往往需要自己编写复杂的算法,增加了开发难度。

    3 年前
  • npm包rtrvr使用教程

    在前端开发过程中,我们经常需要使用一些第三方库或者工具来辅助我们的开发。而 npm 是一个非常流行的 Node.js 包管理器,它提供了几乎所有我们所需要的包和工具。

    3 年前
  • npm 包 scrixel-map 使用教程

    简介 Scrixel-map 是一个基于 JavaScript 的 npm 包,用于在网页上创建 2D 地图。它使用基于像素的渲染方式,可以创建高效且看起来酷炫的地图。

    3 年前
  • npm 包 node-sc 使用教程

    前言 随着前端技术的发展,现在前端开发人员只是需要掌握 HTML、CSS、JavaScript 是远远不够的了。前端开发人员还需要掌握各种前端工具和框架。而 node-sc 就是这样一款十分实用的前端...

    3 年前
  • npm 包 json-populate 使用教程

    前言 在前端开发过程中,我们常常需要对 JSON 数据进行处理和使用。而对于这些数据的处理,我们通常会使用第三方的库来实现,这就使得我们的开发工作更加高效和便捷了。

    3 年前
  • npm 包 data-provider-temporary 使用教程

    前言 在前端开发过程中,我们经常需要将请求到的数据存储在本地,在后续开发过程中调用本地存储的数据而不用再次请求服务器。而传统的本地存储方法比如 localStorage 或者 cookie 存储,可能...

    3 年前

相关推荐

    暂无文章