本文介绍如何使用 npm 包 higlass-labeled-annotation,该包是 higlass 的一个插件,用于为 higlass 中的视图添加标注和注释。本文将详细介绍如何使用该包,并提供示例代码,帮助读者快速上手。
环境
在开始之前,你需要:
- 了解并安装 higlass,higlass 是一个基于 web 的可视化工具,用于可视化大规模数据。
- 了解并安装 npm,npm 是一个 Node.js 的包管理工具。
安装
使用 npm 安装 higlass-labeled-annotation:
--- ------- --------------------------
使用
在 higlass 中使用 higlass-labeled-annotation 的示例代码:
------ - ---- - ---- ---------- ------ ----------------- ---- ----------------------------- -- ---- ----- --- - -------------------------------------------------------- -- ------- -------------- ----- ------------------------------ ----- - ----- ------------------- ----- -- ---------- --- ---- --- ---- ---- ------ ----- ----- ----- ------- ---- ---------------- ------- ------ ------ ----------- -------- ------- -- -- -- -- -- ----------------- -- -------- - ------- ------------------- - ---
示例代码中使用了 labeledAnnotation 插件,该插件会为基因注释添加标签和注释。
参数
labeledAnnotation 插件支持以下参数:
参数名 | 类型 | 说明 |
---|---|---|
fontSize |
number |
字体大小 |
fontFamily |
string |
字体 |
labelColor |
string |
标签颜色 |
labelSize |
number |
标签大小 |
labelStroke |
string |
标签描边颜色 |
labelFill |
string |
标签背景色 |
labelOpacity |
number |
标签透明度 |
labelStrokeWidth |
number |
标签描边宽度 |
annotationColor |
string |
注释颜色 |
annotationFontFamily |
string |
注释字体 |
annotationOpacity |
number |
注释透明度 |
lineColor |
string |
连接线颜色 |
lineWidth |
number |
连接线宽度 |
示例代码中仅使用了 labelColor
和 labelSize
参数:
-------- - ------- -------------------- --------- --- ----------- -------- ---------- -- -
结语
本文介绍了 npm 包 higlass-labeled-annotation 的使用方法,并提供了示例代码和参数说明,帮助读者快速上手该包。使用 higlass-labeled-annotation 可以为 higlass 中的视图添加标注和注释,使数据可视化更加丰富和直观。
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